Трёхнефная базилика расположена в селе Болниси, в регионе Квемо-Картли на востоке Грузии, в Болнисском муниципалитете.
На фасадах Болнисского собора сохранились древнейшие в Грузии грузинские надписи. В соборе также имеются различные изображения христианского символа – креста. Одно из них (расширённый крест в круглой рамке) известно как «Болнурский крест».